Sale ekspozycyjne urządzono w zabytkowych kamienicach, z których jedna należała do Przypkowskich, a druga została zakupiona na potrzeby Muzeum. Zwiedzający mogą dziś obejrzeć dawne mieszkanie rodziny z początku XX w. pełne pamiątek – gabinet lekarski Feliksa Przypkowskiego, z zawodu lekarza, a z zamiłowania astronoma i gnomonika, założyciela kolekcji; dalej salon, bibliotekę, jadalnię, sypialnię i kuchnię. W drugiej kamienicy urządzono ekspozycję zegarów słonecznych i udostępniono wnętrza stylizowane na pałacowe apartamenty. Tutaj eksponowane są zabytkowe meble i rzemiosło artystyczne z XVI–XIX w. W piwnicach znajdują się przedmioty związane z gastronomią – ich kolekcję zawdzięczamy kulinarnym zainteresowaniom Tadeusza Przypkowskiego. Magazyny kryją wiele dodatkowych kolekcji, liczny jest zbiór grafik i ekslibrisów, uwagę zwracają pamiątki legionowe oraz judaika – kilkadziesiąt obiektów związanych z kulturą Żydów,. Są to nie tylko przedmioty kultu religijnego, lecz też codziennego użytku. Odrestaurowany w ostatnich latach Ogród Czasu to miejsce otoczone murami ozdobionymi znakami zodiaku i tajemniczymi symbolami. Tu, przy zabytkowej XVIII-wiecznej altanie i schodach wodnych umieszczono wśród kwiatów i ziół leczniczych różne typy zegarów słonecznych.