W muzealnej kolekcji gromadzone są przedmioty związane z praktykami religijnymi (judaika), obiekty związane z życiem codziennego oraz zbiory archiwalne.
Odrębną część kolekcji stanowią zbiory cyfrowe, m.in. nagrania historii mówionej, wywiady ze świadkami historii (prace uczniów biorących udział w konkursie ,,Nasi sąsiedzi – Żydzi’’).
Kolekcja dokumentuje historię społeczności żydowskiej do czasów II wojny światowej. W zebranych relacjach audio i wideo zachowane są m.in. relacje świadków historii o tym, jak wyglądało życie codzienne i religijne społeczności żydowskiej przed wybuchem II wojny światowej, oraz relacje dotyczące czasów Zagłady.